Es una modificación de la PCR convencional en la que se cuantifica de forma absoluta o relativa el producto de amplificación del DNA. Además de la mezcla habitual de una reacción PCR, cuenta con una sustancia marcada con un tinte que emite fluorescencia (fluorocromo). Se realiza en un termociclador con sensores para medir esa fluorescencia, los cuales, tras excitar este fluorocromo a la longitud de onda apropiada, permiten medir a uno o más productos específicos.
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